師資
苑秋月博士，南方科技大學助理教授，博士生導師。2016年本科畢業于北京師范大學數學與應用數學專業，2021年獲得中國科學院數學與系統科學研究院運籌學與控制論博士學位；隨后在美國克萊姆森大學人類遺傳學中心從事博士后研究，專注于在單細胞多組學上構建基因調控網絡；2025年2月加入南方科技大學醫學院。研究結合了數學建模、人工智能和生物多組學數據，致力于揭示基因調控的動態機制及其在精準醫學中的應用。迄今已發表多篇高質量學術論文，包括以第一作者（含共同第一作者）身份在 Nature Biotechnology、Genome Biology、Nature Communications 等國際期刊的科研成果。
研究領域
1. 開發可解釋的人工智能模型，單細胞多組學數據解析基因調控網絡，推動精準醫學和個性化治療的發展。
2. 從調控的角度揭示細胞命運決定的分子機制。
3. 結合優化算法和機器學習，解決生物醫學中的復雜數據分析問題。
教育背景
博士：運籌學與控制論，中國科學院數學與系統科學研究院，2016年9月-2021年6月
本科：數學與應用數學，北京師范大學，2012年9月-2016年7月
工作經歷
博士后：克萊姆森大學人類遺傳學中心，2021年8月-2025年2月
助理教授：南方科技大學醫學院，2025年2月–至今
獲獎情況及榮譽
2015年 國家獎學金
2016年 北京市優秀畢業生
2018年 首屆全球運籌學挑戰賽季軍
2020年 中國科學院數學與系統科學研究院院長獎學金特別獎
雜志編委會委員
擔任 Nature Communications，Gigascience，Frontiers in Genetics 等學術期刊的審稿人。
近年代表文章
*為共同第一作者
Yuan, Qiuyue, and Zhana Duren. "Inferring gene regulatory networks from single-cell multiome data using atlas-scale external data." Nature Biotechnology (2024): 1-11. https://www.nature.com/articles/s41587-024-02182-7
Yuan, Qiuyue, and Zhana Duren. "Integration of single-cell multi-omics data by regression analysis on unpaired observations." Genome Biology 23.1 (2022): 160. https://link.springer.com/article/10.1186/s13059-022-02726-7
Fei Li*, Qiuyue Yuan*, Wei Di, Xinyi Xia, Zhuang Liu, Ninghui Mao, Lin Li, Chunfeng Li, Juan He, Yunguang Li, Wangxin Guo, Xiaoyu Zhang, Yiqin Zhu, Rebiguli Aji, Shangqian Wang, Xinyuan Tong, Hongbin Ji, Ping Chi, Brett Carver, Yong Wang, Yu Chen, and Dong Gao. ERG orchestrates chromatin interactions to drive prostate cell fate reprogramming[J]. Journal of Clinical Investigation, 2020. https://www.jci.org/articles/view/137967
Zhu, Yanjing*, Shijie Tang*, Qiuyue Yuan*, Jing Fu*, Juan He*, Zhuang Liu, Xiaofang Zhao et al. "Integrated characterization of hepatobiliary tumor organoids provides a potential landscape of pharmacogenomic interactions." Cell Reports Medicine 5, no. 2 (2024). https://www.cell.com/cell-reports-medicine/pdf/S2666-3791(23)00604-3.pdf
Xiaohan Shi*, Yunguang Li*, Qiuyue Yuan*, Shijie Tang*, Shiwei Guo*, Yehan Zhang, Juan He, Xiaoyu Zhang, Ming Han, Zhuang Liu, Yiqin Zhu, Suizhi Gao, Huan Wang, Xiongfei Xu, Kailian Zheng, Wei Jing, Luonan Chen, Yong Wang, Gang Jin & Dong Gao. "Integrated profiling of human pancreatic cancer organoids reveals chromatin accessibility features associated with drug sensitivity." Nature Communications 13.1 (2022): 1-16. https://www.nature.com/articles/s41467-022-29857-6
Qiuyue Yuan, and Yong Wang. 3Scover: Identifying Safeguard TF from Cell Type-TF Specificity Network by an Extended Minimum Set Cover Model[J]. iScience, 2020, 23(6): 101227. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2589004220304120
Meng Zou, Zhana Duren, Qiuyue Yuan, Henry Li, Andrew Paul Hutchins, Wing Hung Wong, and Yong Wang. "MIMIC: an optimization method to identify cell type-specific marker panel for cell sorting." Briefings in bioinformatics 22.6 (2021): bbab235. https://academic.oup.com/bib/article/22/6/bbab235/6309927?login=true
Guofeng Zhou, Shaoyan Sun, Qiuyue Yuan, Run Zhang, Ping Jiang, Guangyu Li, Yong Wang, and Xiao Li. "Multiple-Tissue and Multilevel Analysis on Differentially Expressed Genes and Differentially Correlated Gene Pairs for HFpEF." Frontiers in genetics 12 (2021). https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8296822/
Jingxue Xin*, Hui Zhang*, Yaoxi He*, Zhana Duren*, Caijuan Bai*, Lang Chen, Xin Luo, Dong-Sheng Yan, Chaoyu Zhang, Xiang Zhu, Qiuyue Yuan, Zhanying Feng, Chaoyiing Cui, Xuebin Qi, Ouzhuluobu NA, Wing Wong, Yong Wang, and Bing Su. Chromatin accessibility landscape and regulatory network of high-altitude hypoxia adaptation[J]. Nature communications, 2020, 11(1): 1-20. https://www.nature.com/articles/s41467-020-18638-8