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車駿
研究序列副教授
chej@mail.sustech.edu.cn

個(gè)人簡(jiǎn)介:

車駿,副研究員,醫(yī)學(xué)院研究序列副教授。于2015年博士畢業(yè)于美國(guó)德州大學(xué)健康科學(xué)中心。2015-2020年在美國(guó)德州大學(xué)健康科學(xué)中心做博士后及副研究員。專注于DNA損傷修復(fù),DNA重組和DNA損傷耐受的基礎(chǔ)生物學(xué)研究。目前已在Nature Structural & molecular biology, The EMBO Journal, PLoS Genetics, Microbial Cell 等雜志發(fā)表文章8篇。

 

研究領(lǐng)域

1 DNA損傷耐受的生物學(xué)機(jī)制

2 DNA損傷修復(fù)和損傷耐受的表觀遺傳學(xué)

 

教育背景:

2008-2015 理學(xué)博士 遺傳學(xué) 德州大學(xué)健康科學(xué)中心  美國(guó)

2004-2007 碩士 細(xì)胞遺傳學(xué) 中國(guó)科學(xué)院昆明動(dòng)物研究所

2000-2004工學(xué)學(xué)士 生物工程 西安交通大學(xué)

 

工作經(jīng)歷:

12/2020-至今 研究序列副教授,南方科技大學(xué)

08/2015 -10/2020 博士后及副研究員,德州大學(xué)健康科學(xué)中心  美國(guó)

01/2008-07/2008 項(xiàng)目負(fù)責(zé)人,北京華大基因

 

獲獎(jiǎng)情況及榮譽(yù):

德州CPRIT 博士生獎(jiǎng)學(xué)金 2011,2012

 

研究領(lǐng)域:

DNA損傷耐受

從原核到真核,每一個(gè)細(xì)胞、每一天都會(huì)發(fā)生大量的不同類別的DNA損傷 (每10kb DNA約1個(gè)DNA損傷)。雖然大部分損傷可以被不同的DNA損傷修復(fù)通路清除掉,沒有被修復(fù)的DNA損傷會(huì)嚴(yán)重影響依賴于DNA模板的生物學(xué)過程,比如DNA復(fù)制和轉(zhuǎn)錄。當(dāng)DNA復(fù)制開始后,細(xì)胞有一種機(jī)制使得復(fù)制叉可以暫時(shí)越過這些DNA損傷,而不是修復(fù)它們,從而確保DNA復(fù)制的完成。這一機(jī)制被稱為DNA損傷耐受(DNA damage tolerance,DDT)。它是基因突變和染色體發(fā)生重排最重要的原因。因此與癌癥,衰老,耐藥的產(chǎn)生等多種疾病有著密切的關(guān)系。

DDT包含跨越損傷合成(Transleion synthesis,TLS)和模板切換(template switching,TS)兩條通路。盡管該機(jī)制已被研究了近半個(gè)世紀(jì),仍然有許多重要的問題沒有被解答。比如,TLS和TS兩條通路是如何被細(xì)胞選擇的?DDT具體在什么時(shí)間發(fā)生,是在復(fù)制叉受阻停滯的地方,還是復(fù)制叉通過以后??jī)蓷l通路涉及到一個(gè)最為重要的分子及修飾是PCNA K164的單泛素化和多聚泛素化(K63-linkaged),雖然介導(dǎo)他的酶發(fā)現(xiàn)已久,但是人們對(duì)于PCNAK164多聚泛素化如何促進(jìn)模板切換(TS)通路卻仍然未知。

我們使用模式生物釀酒酵母在這一領(lǐng)域深耕多年,目前已經(jīng)取得了重要的進(jìn)展。我們開發(fā)出一系列獨(dú)特的遺傳學(xué)和分子生物學(xué)方法并發(fā)現(xiàn)了新的分子和調(diào)節(jié)機(jī)制,這將為回答上述難題奠定重要的基礎(chǔ)。

 

發(fā)表論文:

1 Li X, McConnell K, Che J, Ha C, Lee SE, Kirby N, Shim EY. DNA Dosimeter Measurement of Relative Biological Effectiveness for 160 kVp and 6 MV X Rays. Radiat Res 2020 Aug 1;194(2):173-179.

2 Lee K, Ji JH, Yoon K, Che J, Seol JH, Lee SE, Shim EY. Microhomology Selection for Microhomology Mediated End Joining in Saccharomyces cerevisiae. Genes (Basel). 2019 Apr 8;10(4).

3 Li F, Wang Q, Seol JH, Che J, Lu X, Shim EY, Lee SE, Niu H. Apn2 resolves blocked 3' ends and suppresses Top1-induced mutagenesis at genomic rNMP sites. Nat Struct Mol Biol. 2019 Mar; 26 (3):155-163.

4 Klein HL, Ba?inskaja G, Che J, Cheblal A, et al, Guidelines for DNA recombination and repair studies: Cellular assays of DNA repair pathways. Microb Cell. 2019 Jan 7;6(1):1-64.

5 Jun Che, Stephanie Smith, Yoo Jung Kim, Eun Yong Shim, Kyungjae Myung & Sang Eun Lee. Hyper-acetylation of Histone H3 K56 limits break-induced replication by inhibiting extensive repair synthesis. PLoS Genetics 2015 Feb 23;11(2):e1004990.

6 Sung S, Li F, Park YB Kim JS, Kim AK, Song OK, Kim J, Che J, Lee SE, Cho Y. DNA end recognition by the Mre11 nuclease dimer: insights into resection and repair of damaged DNA EMBO J. 2014 Aug 8. pii: e201488299. [Epub ahead of print]

7 Niu AL, Wang YQ, Zhang H, Liao CH, Wang JK, Zhang R, Che J, Su B. Rapid evolution and copy number variation of primate RHOXF2, an X-linked homeobox gene involved in male reproduction and possibly brain function. BMC Evolutionary Biology 2011, 11:298

8 Che J, Wang J, Su W, Ye J, Wang Y, Nie W, Yang F, Construction, characterization and FISH mapping of a bacterial artificial chromosome library of Chinese pangolin (Manis pentadactyla). Cytogenet Genome Res, 2008. 122(1): p. 55-60.

 

 

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